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学院“岱下学宫-民之天论坛”学术报告
发布时间:2023-04-10
作者:学院
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题目:大数据驱动的小麦-白粉菌相互作用机制解析初探
主讲:贺飞研究员
时间:4月12日14:30
地点:学实楼601
主讲人简介:
贺飞,中科院遗传与发育生物学研究所研究员,中科院-英国约翰·英纳斯中心(JIC)植物和微生物联合研究中心(CEPAMS)课题组组长。本科毕业于西南大学农学与生命科学学院,2011年在中国农业大学生物学院获得生物信息学博士学位,先后在美国斯隆凯特琳癌症中心、布鲁克海文国家实验室、堪萨斯州立大学从事博士后研究。长期从事生物信息学与农作物基因组学研究。
由专性活体寄生的白粉菌 (Bgt, Blumeria graminins f. sp. tritici)引起的白粉病,严重威胁着中国的小麦生产。发掘小麦中的白粉病抗性基因(R基因)和Bgt中相应的无毒基因(Avr基因),以及了解它们之间相互作用的分子机制,有助于开发新的白粉病防治手段。到目前为止,已克隆的R基因和Avr基因数量有限,阻碍了我们对它们之间分子识别机制的理解。贺飞博士搭建了小麦-白粉菌相互作用表型筛查平台,完成了对100多份小麦白粉菌小种的基因组测序工作,已进行500份小麦与100份白粉小种的相互作用表型鉴定工作,通过双向全基因组关联研究(biGWAS)快速挖掘R-Avr互作。结合现有的基因型数据和表型数据,进行了跨物种的GWAS初步分析,结果表明该策略可以鉴定出已知和未知的R/Avr基因。